O jogo possui um tabuleiro de palavras-cruzadas e um conjunto de dicas relacionadas para ajudar a encontra-las. O Cruzadinha: Jardim Medicinal é dividido em três temas de jogo randômico, ou seja, pode reiniciar o jogo com tabuleiro diferente para se divertir por muito tempo. Os temas apresentados são; Uso da planta, Nome Popular e Curiosidade.